1、 肿瘤及其肿瘤间质病理生物学研究
主要开展肿瘤间质新生血管内皮细胞的异质性的研究；金属蛋白酶、细胞外基质和基质粘附受体在血管发生、发展中的作用研究；以肿瘤或肿瘤间质为靶点的抗肿瘤基因治疗的研究。

2、 干细胞组织工程学研究
该方向以胚胎干细胞、成体干细胞的分离、培养、扩增、诱导和分化技术为主线，重点开展了成体干细胞系、胚干细胞系的建立以及干细胞在体外向特定组织器官的诱导、分化，包括软骨、皮肤、血管组织工程学研究。

3、 地理病理生物学研究
主要研究在我国危害严重的克山病、大骨节病、地氟病等地方病的病理、病因与发病机制，预防及干预措施，并由此向相关领域扩展，发展具有我国特色的地理病理生物学。

肿瘤间质病理学已有20多年的历史，已经形成了自己的优势和特色；地理病理学属国内独有；干细胞组织工程的研究已跻身于国内同类研究的前列。