智能信息处理重点实验室 生物信息学研究组

实验室名称:
生物信息学研究组
所属单位:
中国科学院 计算所 智能信息处理重点实验室
地点:
北京市

中国科学院 计算所 智能信息处理重点实验室 生物信息学研究组

      人类基因组计划的初步成功,证明了以大规模DNA测序(包括基因组与cDNA) 为基础,以生物信息学为先导的生物资源信息强化开采,是发现、鉴定新基因最有效、最经济的方法。也意味着人类基因组的研究将全面进入信息提取和数据分析阶段,即生物信息学发挥重要作用的阶段。到1999年12月15日发布的第115版为止,GenBank中的DNA碱基数目已达46亿5千万,DNA序列数目达到535万;其中EST序列超过339万条; UniGene的数目已达到7万个;已有25个模式生物的完整基因组被测序完成,另外的70个模式生物基因组正在测序当中;到2000年6月28日为止,人类基因组已有16%的序列完成测定,另外37.7%的序列已经初步完成;同时功能基因组和蛋白质组的大量数据已开始涌现。如何分析这些数据,从中获得生物结构、功能的相关信息是基因组研究取得成果的决定性步骤。

   以大规模序列信息产出为基本特征的人类基因组计划,对计算机科学和信息技术无疑是一种压力和挑战。 值得庆幸的是,人类基因组计划一开始就与信息高速公路和数据库技术形成了同步发展。迄今,国际上三个大的生物信息中心即美国的国家生物技术信 息中心(NCBI)、欧洲生物信息学研究所(EBI)和日本DNA数据库(DDBJ)已经建立和维持了源自数百种生物的DNA序列的大型数据库。这些中心和全球的基因组研究实验室通过互联网联系,可供研究者在多种不同的分析系统中对序列数据提出质询,这些分析包括基因的识别,蛋白质模体的鉴定,调控元件的分析,重复序列的鉴别,相似性的分析,核苷酸组成的分析以及物种间的比较等 。

   各大计算机公司也纷纷投巨资加强超性能计算机的研制工作。为了满足人类基因组计划的研究需要,IBM至今在生物科技领域已经投资2亿美元,集中了不同领域的50名研究员,专门从事计算机应用于生物科技领域的研究,投入1亿美元开发出了世界排名第一、有100万个CPU、每秒运算速度高达千万亿次的超级计算机"蓝色基因",专为生物科学研究服务。

     国际上生物信息学发展异常迅猛,同时大大带动了我国生物信息学的发展。但是我国生物信息学由于起步较晚,目前远落后于发达国家,甚至许多方面都是空白。为此,我们创立了promotor生物信息处理平台,以促进我国生物信息学的发展。

实验室分类信息
研究方向: 主要研究方向
实验室负责人: 陈润生
科研团队: 科研团队
研究成果: 主要研究成果
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