王进

研究方向

研究领域：生物信息学，分子生物学

1． 基因调控序列分析、位点预测与调控机理研究；

2． 基因转录调控网络研究；

3． 蛋白质结构与分子设计

联系方式

办公电话：025-83686785；

邮寄地址：南京市汉口路22号南京大学 生命科学学院 生化系
邮政编码：210093
电子邮件：jwang@nju.edu.cn

个人简历

学习经历：

1980-1984年：南京大学，获学士学位
1984-1987年：南京大学，获硕士学位

工作经历：

1987年至今：南京大学，教学、科研
1995-1997年：美国加州大学洛杉矶分校，访问研究员

承担课程：

本科生：《生物信息学》
研究生：《蛋白质工程原理与应用》

主持或者参与的项目：

1. 基于表达调控网络的基因功能预测研究，973子课题，2003-2007年, 主持

2. 真核基因转录调控的信息结构与作用机理，国家自然科学基金重大计划项目，2003-2006年，主持

3. 小鼠遗传资源生物信息平台，科技部专项基金，2003-2005年，合作

4. 基因序列模式识别，IBM-SUR计划项目，2003-2005年，主持

5. 基因调控的生物信息学，中德中心国际合作项目，2003-2005年，合作

6. 真核基因转录调控的协同机制研究及理论模型，国家自然科学基金项目，2000-2002年，主持

7. 基因生物信息系统多尺度结构的复杂性研究，国家自然科学基金项目，2000-2002年，主持

科研成果

论文：

1. MED: a new non-supervised gene prediction algorithm for bacterial and archaeal genomes, Huaiqiu Zhu, Gang-Qing Hu, Yi-Fan Yang, Jin Wang and Zhen-Su She, BMC Bioinformatics, 8:97 (2007)

2. MACO: A gapped-alignment scoring tool for comparing transcription factor binding sites, Gang Su, Binchen Mao and Jin Wang*, In Silico Biology 6, 0028 (2006);

3. A web server for transcription factor binding site prediction, Gang Su, Binchen Mao, Jin Wang*, Bioinformation, 1(5): 156-157 (2006)

4. Fusion protein between protein ZZ and red fluorescent protein DsRed and its application to immunoassays. Huang QL, Chen C, Chen YZ, Gong CG, Cao L, Wang J, Hua ZC., Biotechnol Appl Biochem. 43(Pt 2):121-7 (2000)

5. Application to immunoassays of the fusion protein between protein ZZ and enhanced green fluorescent protein, Qi-Lai Huang, Cheng Chen, Yun-Zi Chen, ChenGuang Gong, Lin Cao, Jin Wang, Zi-Chun Hua, Journal of Immunological methods, 309:130-138 (2006)

6. 园艺植物分子育种相关生物信息资源及其应用,张长青,王进,李广平,章镇, 植物学通报, 22(4):494-501 (2005)

7. Accuracy improvement for identifying translation initiation sites in microbial genomes, Huai-Qiu Zhu, Gang-Qing Hu, Zhwng-Qing Ouyang, Jin Wang, Zhen-Su She, Bioinformatics, Vol.20, No.18, pp3308-17 (2004)

8. The immobilized template assay for measuring cooperativity in eukaryotic transcription complex assembly, Johnson KM, Wang J, Smallwood A, et al., METHOD ENZYMOL 380: 207-219 (2004)

9. Enrichment of transcriptional regulatory sites in non-coding genomic region, W.Xue, J.Wang*, Z.Sheng, H.Zhu, Bioinformatics Vol.20, No.4, pp569-575 (2004)

10. A unique ATG triplet downstream of gene start in archaea: implications for translation initiation and evolution, X.Cang, J.Wang*, Gene, Vol.327, pp75-79 (2004)

11. Multivariate Entropy Distance Method for Prokaryotic Gene Identification，Zhengqing Ouyang, Huaiqiu Zhu, Jin Wang and Zhen-Su She*，Journal of Bioinformatics and Computational Biology, Vol.2, No.2, pp353-373(2004)

12. SARS冠状病毒依赖的RNA聚合酶(RdRp)蛋白保守氨基酸基序的鉴定，张大鹏，王进，杨洁，华子春，病毒学报，20（4），371-377（2004）

13. TFIID and human mediator coactivator complexes assemble cooperatively on promoter DNA, K.M.Johnson, J.Wang, A.Smallwood, C.Arayata and M.Corey, Genes & Development, Vol.16, No.14, pp1852-1863 (2002)

14. 真核基因转录激活的多位点协同调控，薛文 王进 黄启来 郑伟娟 华子春，生物化学与生物物理进展，29(4), pp510-513 (2002)

15. Multi-scaling hierarchical structure analysis on the sequence of E.Coli complete genome, WANG Jin, ZHANG Qidong, REN Kui, SHE Zhensu, Chinese Science Bulletin, 46(23), pp1988-91 (2001)

16. 一种水蛭素类融合蛋白与凝血酶作用的动力学模拟, 范垚, 王进, 杨杉, 杨翔, 张丽娜, 华子春, 朱德煦, 生物化学与生物物理进展, 28(1), pp86-89(2001)

17. A Mathematical Model for Synergistic Eukaryotic Gene Activation , Jin Wang, K.Ellwood, A.Lehman, M.Carey, Z.She, J Mol Biol, 286(2):315-325(1999)

专著：

1. 基础生物化学（上、下册），（朱德煦等译），科学出版社，2003

专利：

1. 用功率超声解聚蛋白质包涵体的方法, 王进， 冯若， 华子春， 陈兆华，朱德煦，(No.ZL 94111488.0, 中国知识产权局)， 1999

2. 人胎盘抗凝蛋白介导的新型抗凝蛋白, 华子春，王进，（申请号：00112527.3， 中国知识产权局），2000