本专业的植物分子生物学和神经分子生物学是上海大学重点发展的专业。在211专项资助下，两者在研究设备和设施上建设完备，建有高规格的分子生物学、神经生物学和基因组学的研究平台。其学术梯队完整，师资力量雄厚。近年来先后承担国家973项目、国家自然科学基金项目、市科委项目和市教委项目等科研项目多项。目前在读研究生近50名。
　　本专业另一个重要研究方向是生物信息学。生物信息学以生物学、数学、计算机科学为基础，结合化学、物理学等多种学科的研究方法和手段，对生物学数据进行搜索（收集和筛选）、处理（编辑、整理、管理和显示）及分析（计算、模拟）。为传统生物学研究开辟了崭新的研究方法和思路，加速了生命科学各方面的研究进展。
　　系统生物学是本专业又一个新兴的研究领域。系统生物学是在分子、细胞、组织、器官和生物体整体水平，研究生命活动的规律，通过基因、蛋白等生物大分子结构及其相互作用，解析信号传导、代谢网络途径，定量描述和预测生物功能，为破译生命密码、新药研发、疾病预防和治疗提供理论与技术支撑。
　　分子识别与生物传感是新增的研究方向。生物传感器是在医疗诊断和生命科学研究中应用最为广泛的测试器件之一。随着生命科学与材料、信息、化学、物理等学科间的交叉渗透，生物传感这一多学科交叉研究领域得到了飞速发展。其中，基于蛋白质直接电化学与酶的固定化技术的电流式生物传感器的研究在国际上尤为活跃。本研究方向的工作主要在蛋白质的电子传递、界面行为及其与生物小分子（包括纳米材料）的相互作用方面开展，研究工作也包括所涉及生物分子的电信号。最终以发展新型生物传感器以及生物活性物质检测的新方法为研究的中心。
　　指导教师：许政暟教授、吉永华教授、尹京苑教授、文铁桥教授、陈宇光教授、李根喜教授、宋任涛教授、王健教授、宋红生副教授、陈付学副教授、邓志瑞副教授、郭景康副教授等。
　　研究方向：01. 植物分子生物学
　　　　　　　 02. 神经分子生物学
　　　　　　　 03. 生物信息学
　　　　　　　 04. 系统生物学
　　　　　　　 05. 分子识别与生物传感
　　招生人数：30名（植物11人，神经8人，生物信息6人，系统生物学1人，分子识别与生物传感4人）
　　考试科目：1. 101政治
　　　　　　　 2. 201英语
　　　　　　　 3. 630细胞生物学(01、02、04、05方向)或631生物数学（03方向）
　　　　　　　 4. 861生物化学（01、02、05方向）或862现代分子生物学（03方向）或863基因工程（04方向）
　　　　　　　 5. 植物生物学（01方向）（复试科目），神经生物学（02、04方向）（复试科目），生物信息学（03方向）（复试科目），普通生物学（04方向）（复试科目），分子识别与生物传感（05方向）（复试科目）