计算生物学研究所2007年招收硕-博连读研究生
中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所（中国科学院－马普学会计算生物学伙伴研究所）（以下简称计算生物学研究所）是我国首个计算生物学研究所，由中国科学院与德国马克斯•普郎克学会（简称马普学会）于2005年10月13日在上海生命科学研究院内合作共建。马普学会是德国政府资助的全国性研究机构，也是德国最大的研究机构，成立于1948年2月，现有79个研究机构，人员1万2千多人，主要从事自然科学、人文科学和社会科学的基础研究。马普学会在世界科学界享有很高的声望。1954年以来，德国有30名诺贝尔奖获得者，其中一半来自马普学会。

自从世界各国展开人类基因组计划的研究以来，生命科学面临前所未有的数据挑战。如今，全球每14个月基因研究产生的数据就会翻倍，与此同时，每月测出的有关蛋白质的结构数据至少也有150种。因而，要破译“生命天书”，就要在基因组、蛋白质组等的海量数据中上下求索，生物学不再是“数学等于零”的学科，也不再仅仅基于观察和实验，而是越来越多地使用数学、物理、计算机科学的理论与方法。而运用理论模型、数值计算研究生命科学的计算生物学由此成为最具魅力的新兴学科之一，也是当今生命科学和自然科学最具活力的核心领域。

我所致力于以现代分子生物学数据作为主要研究对象，发展理论模型和计算方法，开发和应用数据分析、理论方法、数学模型和计算机仿真技术，用于生物学、行为学和社会群体系统的研究，以揭示出生物的复杂性和定量活动规律。同时我所还担负着培养计算生物学领域多学科、多层次高级人才的重要职责。

我所目前主要实验室有：组合数学与几何学实验室、群体遗传学实验室。组合数学与几何学实验室的研究领域包括：组合学在系统发生学中的应用，分子进化，蛋白质组学和计算化学中的拓扑学方法；生物数据分析中的模式识别算法；数据可视化图像处理；生物医学图像处理；拓扑蛋白质组学等； 群体遗传学实验室的研究领域包括：群体遗传结构研究；人类复杂遗传疾病研究 ；生物网络重组研究 ；新陈代谢通道及控制模型研究等。

我所拥有一支来自世界各地的导师队伍。他们学术造诣深厚、专业背景多元化，充分体现了我所多学科交叉研究的特点。他们曾在《Nature》、《Science》、《Advance in Mathematics》、《PNAS》等顶级刊物发表论文多篇。目前在岗导师8名，其中5名来自德国， 1名来自俄罗斯。

导师的详细情况请看导师简介

我所成立的宗旨之一就是开展广泛的国内国际学术交流，成为中国与国际计算生物学界进行高层次学术交流的窗口和基地。在成立不到一年的时间内，我所已成功主办了三次涉及计算生物学和进化生物学等领域的高水平、高质量的国际学术研讨会。共邀请80多位海内外著名专家学者出席大会并作报告，如美国的Masatoshi Nei教授，新西兰的David Penny教授，德国的Syvente Pääbo教授等。这些会议极大地促进了学术交流合作的进程，提升了我所在计算生物学领域的影响力。在与国内外合作方面，我所与国内外多所大学及研究机构建立了合作关系。与德国 Magdeburg 大学联合建立的“拓扑蛋白质组学中心”已进入筹备阶段；与英国的东英格兰大学，美国的斯坦福大学、加里福尼亚大学、宾夕法尼亚大学，德国的莱比锡大学、比勒费尔德大学、新西兰的艾伦威尔森分子生态和进化中心，土耳其的中东技术大学建立了良好的合作关系。国内方面，我所与上海巴斯德研究所、南开大学、复旦大学、上海交通大学等院校已开展了众多学术交流活动，并将进一步建立合作关系。

我所已构建一个一流的科学计算支撑平台，拥有一套包含200多常用生物运算软件的生物集群系统，其中包括mpiBLAST, EMBOSS 和HMMER，能够根据用户的定义,随时扩充和更新最新的基因数据库。同时我们的生物集群系统拥有18个苹果Xserver G5 运行节点, 该服务器拥有完善的64位G5中央处理器, 能更好地支持双精度浮点运算和向量加速运算. 此外,我们还通过组建SAN 存储,构造了千兆级海量存储单位.

计算生物学研究所是一个有着美好的发展前景和广阔的发展空间的新兴科研机构，欢迎有志于从事计算生物学研究的广大学生踊跃报考。

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地址：上海市徐汇区岳阳路320号计算生物学研究所
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