“蛋白质药物北京市重点实验室”成立于2008年3月，实验室负责人为清华大学罗永章教授。实验室的主要研究方向是：蛋白质药物作用机理，蛋白质药物靶点筛选；开发针对肿瘤、老年痴呆症等重大疾病的创新药物；对蛋白质药物产业化发展的大规模蛋白质药物制备技术进行攻关，研发具有自主知识产权的核心技术和关键工艺，建立国际领先的重组蛋白生产制备平台；蛋白质药物构象及生物学活性检测技术的基础研究。

抗肿瘤蛋白质药物国家工程实验室
2008年8月13日，“抗肿瘤蛋白质药物国家工程实验室”正式成立，实验室负责人为清华大学罗永章教授。

江苏省脑病生物信息重点实验室

湖南省蛋白质组学与发育生物学重点实验室依托于湖南师范大学。 1995年，湖南省蛋白质化学及分子生物学重点实验室经湖南省科委（现科技厅）批准建立,1997年在全省24个重点实验室评估中名列第一，核准为AAA实验室；2001年在全省重点实验室评估中获得优秀。为了适应生命科学发展的需要，实验室凝练研究方向，2002年经湖南省科技厅批准，本实验室更名为湖南省蛋白质组学与发育生物学重点实验室。

蛋白质工程和植物基因工程国家重点实验室

卫生部肿瘤蛋白质组学重点实验室于2003年正式挂牌。其前身是1999年成立的中南大学湘雅医院肿瘤蛋白质组学实验室。室主任由博士生导师陈主初教授担任，副主任由博士生导师肖志强教授担任。自成立以来，在实验室建设、科研和人才培养诸方面都取得了显著成绩。该室已形成一支以中青年为主，学术梯队配套，科研方向稳定，科研水平较高，团结协作，刻苦钻研，勇于探索，努力奋进的科研和教学集体。

中国科学技术大学田长麟实验室

田长麟实验室--膜蛋白结构与功能的研究

中国科学技术大学周丛照实验室

基于三维结构的参与氧化应激反应的蛋白质相互作用网络

中国科学院水生生物研究所 水生动物蛋白质工程学科组

学科带头人：戴和平

学科组成员：戴和平 张小华 戴玲芬 袁丽 肖囡 王玉珍 张敏 徐涛 扬毅 饶瑜

 北京师范大学 高等学校蛋白质组学研究院

      人类基因组计划的开展，特别是2001年2月12日人类全部DNA框架图的发布，标志着蛋白质组学成为生命科学新的热点与前沿。