2001年12月，南京大学实施了总投资为5000万元的国家“十五”科技攻关重点项目“国家遗传工程小鼠资源库的建立”，并相应成立了南京大学模式动物研究所。

本实验室从事鱼类功能基因组及系统演化，水生动物生理生化（主要是水生动物环境响应的分子机制）等方面的研究。
实验室负责人孔祥会教授长期以来从事水生动物功能基因组学、系统发育、分子进化和物种分化、环境效应与水生动物健康、生物信息学等相关领域的研究工作，并取得系列的研究成果。
本实验室及其所在的生命科学学院拥有优良的实验设备、科研条件及良好的学术氛围。

农业部家畜生殖内分泌及胚胎工程重点开放实验室

农业部家畜生殖内分泌与胚胎工程重点开放实验室，于 1980 年 8 月经农业部批准成立， 1992 年被农业部正式命名。实验室主任由张涌教授担任。

实验室的主要研究方向及研究领域为：

1 、家畜胚胎工程： 优化和集成活体采卵与体外受精技术、胚胎克隆技术、胚胎冷冻技术、性别控制技术，开发大批量生产已知性别的良种牛羊体外胚胎的技术。

动物营养学国家重点实验室

动物营养学国家重点实验室是在农业部动物营养学重点开放实验室基础上立项建设的，由中国农业科学院畜牧研究所和中国农业大学强强联合共建。在农业部历届重点实验室评估中均取得优异成绩，并被农业部推荐参加2001年度国家生命科学领域重点实验室评估，取得优良成绩。

中国科学院西北高原生物研究所

中国科学院昆明灵长类研究中心 Kunming Primate Research Center,Chinese Academy of Sciences

"中国科学院昆明灵长类研究中心"是中国科学院下属的一个非法人研究单元，挂靠昆明动物研究所，并借鉴国际化管理模式，实行管理委员会领导下的主任负责制。

中国科学院昆明动物研究所 学习记忆实验室

中国科学院昆明动物研究所 灵长类感觉和运动及其整合实验室

中国科学院昆明动物研究所 灵长类认知实验室

中国科学院昆明动物研究所

Kunming Institute of Zoology Chinese Academy of Sciences

所况简介

　　中国科学院昆明动物研究所成立于1959年4月，其前身为昆虫研究所紫胶站。1963年曾改名为中国科学院西南动物研究所，1970年划归云南省后，改名为云南省动物研究所，1978年重归中国科学院，恢复原所名。

现 　状