功能基因组及生物信息学
课题组长：毛裕民 教授； 谢 毅 教授
一、 课题组成员：
李 瑶 教授
应 康 高级工程师
季朝能、顾少华 副教授
戴建凉、吴 海 助理研究员
付旭平 讲 师
董 海、唐 榕 工程师
吴小舟 实验师
二、 主要研究方向：
人类新基因功能研究；
结构生物学；
生物芯片；
生物信息学；
遗传工程；
蛋白质结构与功能
课题组主要成员简介：
毛裕民，1952年3月出生。1988年4月获理学博士学位, 1988年7月任讲师, 1991年5月任副教授, 1993年4月任教授,
1995年2月任博士生导师。现任复旦大学生命科学学院院长、遗传学研究所所长、遗传工程国家重点实验室主任。兼任国务院学位评定委员会生物学科组成员、教育部科技委委员兼生物学部委员、上海市科协常务委员、中国遗传学会常务理事兼副秘书长、上海市遗传学会理事长。91年获"作出突出贡献的中国博士学位获得者"称号。93年被选拔为国家教委首批跨世纪人才。获1项国家教委科技进步三
等奖，1项全军科技进步三等奖，1项国家体育总局科技进步二等奖，及上海市科技进步一等奖1项。
谢毅，1963年6月生。1984年4月毕业于武汉大学（本科），1987年毕业于中国科学院上海细胞生物学研究所（硕士），2001年1月获复旦大学理学博士学位，1987年至今在复旦大学遗传学研究所工作。1992年起任复旦大学遗传学研究所遗传工程国家重点实验室基因分析组组长。1996年5月任副教授，1998年5月任教授，2001年3月任博士生导师。现为《生物工程学报编委》。1993年入选上海市科委启明星，1997年获上海市高校优秀青年教师，2001年被聘任为上海市生物技术领域预见专家，2002年被聘为国家科技部十五"863"生物技术领域评审专家，荣获2000年国家科技进步二等奖，2001年上海市科技进步一等奖，1999年贵州省科技进步二等奖，1999年全军科技进步一等奖，1998年全军科技进步三等奖。
李瑶，女，1965年9月出生。1986.7毕业于复旦大学生物系，本科；1986.9－1989.7就读于复旦大学遗传所，硕士；1990.9－1993.7在复旦大学遗传所获得博士学位。1993.8－1997.6在复旦大学遗传所工作，1996年5月任副教授，2004年任教授。1997.8－1999.1美国纽约州立大学布法罗分校生物系作博士后，1999.3-至今在复旦大学遗传所工作。主持完成国家教委基金一项，上海市科委基金两项。荣获上海市科技进步一等奖一次，复旦大学校三八红旗手一次。
季朝能，男，副教授，博士，1970年8月出生，1992年9月-1998年7月攻读硕士与博士学位期间主要从事蛋白质的热稳定的结构机制研究。1998年7月毕业于复旦大学遗传学研究所，获博士学位，留校工作至今，2004年任副教授。曾获得第一届谈家帧九源奖学金一等奖和2001年上海市青年科技启明星称号。参加过"863基因工程支撑技术"
耐热邻苯二酚2,3双加氧酶的反常散射法的晶体结构研究和自然科学基金重点项目"极端环境下细菌的资源分类及分子生物学的研究"等课题的研究。目前主持国家自然科学基金"耐热邻苯二酚2，3双加氧酶的反常散射法的晶体结构研究"、校青年科学技术基金"耐热碱性磷酸酯酶的晶体结构测定和热稳定机制的研究"、上海市青年科技启明星计划"人基因编码蛋白激酶的功能结构分析"和国家十五攻关西部项目"贵州省少数民族重要缺陷的影响因素及其防治"。是本项目的申请者，负责该项目的设计和具体实施。
三、 2001年以来承担的主要项目：
1. 糖尿病相关基因的克隆及功能研究 科技部863项目 2002.1-2006.12
2. 贵州省少数民族主要出生缺陷的影响因素及其防治(贵州省计划生育研究所, 合作项目) 科技部十五攻关项目 2002.9-2004.9
3. 与人类健康相关的蛋白质结构和医学成像的同步辐射研究 国家自然科学基金重大项目 2004.9-2007.12
4. 人类肝脏结构蛋白质组学研究 国家重点基础研究发展计划 2004.11-2005.12
5. 人类转录因子AP-2家族新基因AP2delta的功能和疾病相关性研究 国家自然科学基金 2004.1-2006.12
6. 新RB结合蛋白RBBP10的功能研究 国家自然科学基金 2003.1-2005.12
7. 中国人肝蛋白质相互作用连锁图的研究 科技部科技重大专项 2004.1.－2005.12
8. 耐热邻苯二酚2，3双加氧酶的反常散射法的晶体结构研 国家自然科学基金2001.1-2003.12
9. APP剪切相关基因FE65L2四种剪切形式的生物学功能 国家自然科学基金2001.1-2003.12
10. 人类全新PDZ蛋白在不对称发育信号传递途径中的作用 国家自然科学基金2001.1-2003.12
11. 一个新的人类类固醇脱氢酶新基因功能及其与疾病相关性的研究 国家自然科学基金 2003.1－2003.12
12. 用酵母双杂交和家系突变分析法克隆非综合性耳聋基因 国家自然科学基金 2001.1-2003.12
13. 几种基因工程HCG嵌合肽免疫原的比较研究（上海市计划生育研究所主申请，合作项目） 国家自然科学基金 2001.1-2003.12
14. 用基因芯片筛查胰腺癌肝转移过程的相关基因群及其功能 （第二军医大学主申请，合作项目 国家自然科学基金2001.1-2003.12
15. 用基因芯片技术研究抗砷相关基因（石河子大学主申请，合作项目） 国家自然科学基金2001.1-2004.12
16. 人类血管紧张素II-型受体结合蛋白新基因的功能研究 国家自然科学基金2002.1-2004.12
17. 一条新型神经发育相关细胞粘附分子的功能研究 国家自然科学基金2002.1-2004.12
18. 同时应用cDNA表达谱和Array-CGH技术研究前列腺癌雄激素敏感和耐受的机制（合作项目） 国家自然科学基金
2004.1-2006.12
19. 砷与肿瘤发生和细胞调亡相关基因的克隆及功能研究 上海市科委西部开发基金 2005.1-2006.12
20. 重组血管生长素（ANG）部分临床前研究 上海市现代生物与新药产业发展基金
21. 积雪草甙对皮肤损伤修复影响因素的实验研究 2001．2-2002．10
22. 贵州省少数民族主要出生缺陷的影响因素及其防治 上海市科委西部开发基金 2002.9-2004.9
四、2001年以来获得学术奖励情况
2001年 上海市科技进步一等奖：基因芯片技术及产品的应用研究与开发
2001年 上海市科技进步二等奖：金属蛋白质的结构-性质-反应-功能关系研究（合作）
2005年 新疆生产建设兵团科技进步一等奖： 用基因芯片克隆人类抗砷相关新基因（合作）
五、申请和获得专利情况
获得国内专利：
1、人绒毛膜促性腺激素基因工程合成嵌合肽及其制备方法，授权时间2005，专利号ZL03115894.3，第1发明单位，发明人谢毅、徐万祥、应康、邱德义、顾少华、廖矛川
2、硅导电玻璃介质生物芯片及其制备方法，授权时间2003，专利号ZL99 1
13481.8，第1发明单位，发明人汪进、黄维宁、李爱珍、姜国宝、程君侠、周鲁卫、杭志强、毛裕民
3、一种端粒酶活性检测方法，授权时间2003，专利号ZL00 1 27583.6，第1发明单位，发明人陈燃、毛裕民
申请国内专利：
1、
人绒毛膜促性腺激素重组多表位嵌合肽CP22抗原的分子设计及其制备方法，国内专利，申请时间2005，专利申请号200510026063.5，第2申请单位，申请人徐万祥、谢毅、廖矛川、季朝能、何亚萍、顾少华、应康、王健、孙志达
2、
人绒毛膜促性腺激素生物合成嵌合肽及其制备方法，国内专利，申请时间2003，专利申请号03115893.5，第2申请单位，申请人徐万祥、谢毅、邱德义、应康、廖矛川、顾少华
六、学生培养情况
2001年以来 已出站博士后 6名
2001年以来 已毕业博士 17名
2001年以来 已毕业硕士 15名
在读博士后： 1名
在读博士：20名
在读硕士：18名
七、发表学术论文：
2001年以来，作为第一单位和通讯作者发表SCI论文110余篇。
代表性论文如下：
1) Lin S, McLennan AG, Ying K, Wang Z, Gu S, Jin H, Wu C, Liu W, Yuan Y,
Tang R, Xie Y, Mao Y. Cloning, expression, and characterization of a
human inosine triphosphate pyrophosphatase encoded by the itpa gene. J
Biol Chem. 2001 Jun 1;276(22):18695-701.
2) Li, Jixi; Wei, Zhiyi; Zheng, Mei; Gu, Xing; Deng, Yingfeng; Qiu, Rui;
Chen, Fei; Ji, Chaoneng; Gong, Weimin; et. al. Crystal Structure of
Human Guanosine Monophosphate Reductase 2 (GMPR2) in Complex with GMP
Journal of Molecular
Biology，
2006， 355（5）： pp. 980-988
3) Han S, Li Y, Mao Y, Xie Y. Meta-analysis of the association of CTLA-4
exon-1 +49A/G polymorphism with rheumatoid arthritis.（2005） Hum Genet.
17;:1-10
4) Xuping Fu, Li Teng, Yao Li, Wenbin Chen, Yumin Mao, I-Fan Shen and Yi
Xie. Finding dominant sets in microarray data. (2005) Frontiers in
Bioscience. 10:3068-3077
5) Huarui Zheng, Chaoneng Ji, Shaohua Gu, Binying Shi, Jin Wang, Yi Xie?,
Yumin Mao?. Cloning and characterization of a novel RNA polymerase II
C-terminal domain phosphatase (2005) BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL
RESEARCH COMMUNICATIONS 331 (4): 1401-1407
6) Jixi Li; Chaoneng Ji; Jinzhong Chen; Zhenxing Yang; Yijing Wang;
Xiangwei Fei; Mei Zheng; Xing Gu; Ge Wen; Yi Xie, Yumin Mao*.
Identification and characterization of a novel Cut family cDNA that
encodes human copper transporter protein CutC. (2005) Biochemical and
Biophysical Research Communications. 337:179-183
7) Qihan Wu, Yao Li, Shaohua Gu, Ni Li, Dan Zheng, Dan Li, Zhongzhou
Zheng, Chaoneng Ji, Yi Xie, Yumin Mao . Molecular cloning and
characterization of a novel dual-specificity phosphatase 23 gene from
human fetal brain. The International Journal of Biochemistry & Cell
Biology 36 (2004) 1542-15533
8) Yao Li, Tao Li, Sanzhen Liu, Minyan Qiu, Zhiyong Han, Zhenling Jiang,
Rongyu Li, Kang Ying, Yi Xie, and Yumin Mao，Systematic comparing the
fidelity of aRNA, mRNA and T-RNA on gene expression profiling using cDNA
microarray. JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 2004, 107 (1): 19-28
9) Zhao EP, Li Y, Fu XP, Zhang JY, Zeng HW, Zeng L, Lin Y, Chen JZ, Yin
G, Qian J, Ying K, Xie Y, Zhao RC, Mao YM. Cloning and expression of
human GTDC1 gene (glycosyltransferase-like domain containing 1) from
human fetal library. 2004. DNA AND CELL BIOLOGY. 23 (3): 183-187
10) Jin-Zhong Chen, Chao-Neng Ji, Shao-Hua Gu, Ji-Xi Li, En-Peng Zhao,
Yan Huang, Lu Huang, Kang Ying,Yi Xie, Yu-Min Mao. Over-expression of
Bim _3, a novel isoform of human Bim, result in cell apoptosis. The
International Journal of Biochemistry & Cell Biology 36 (2004) 1554-1561
11) Liyun Sun, Shaohua Gu, Yaqiong Sun, Dan Zheng, Qihan Wu, Xin Li,
Jianfeng Dai, Jianliang Dai, Chaoneng Ji, Yi Xie and Yumin Mao*. Cloning
and characterization of a novel human phosphatidic acid phosphatase type
2, PAP2d, with two different transcripts PAP2d_v1 and PAP2d_v2.(2005)
Molecular and Cellular Biochemistry 272: 91-96
12) Jixi Li, Chaoneng Ji, Huarui Zheng, Xiangwei Fei, Mei Zheng,
Jianfeng Dai,Shaohua Gu, Yi Xie, and Yumin Mao. Molecular cloning and
characterization of a novel human gene containing 4 ankyrin repeat
domains. (2005) Cellular & Molecular Biology Letters. 10, 185 - 193
