基因与蛋白质功能课题组
课题组长: 霍克克
博士,教授,博士研究生导师
1993年7月于复旦大学生命科学学院遗传学专业博士研究生毕业,获理学博士学位。同年8月留校在遗传工程国家重点实验室工作至今,
现为复旦大学生命科学学院和复旦大学现代生物医学研究院双聘教授、复旦大学药学院兼职教授、"医学分子生物学杂志"编委。主要从事酵母分子遗传学与酵母基因工程学的科研与教学,并以酵母为模式生物进行人类、植物和病原微生物的基因与蛋白质功能研究。曾主持过国家"863"高技术发展计划项目"新的酵母高表达系统的研究"课题。国家自然科学基金项目"重要疾病相关基因功能分析的新技术研究"课题。国家人类基因组南方研究中心"人类基因组计划中酵母菌模式生物系统的研究与应用"课题和"利用酵母双杂交技术研究人类新基因功能及其编码蛋白质的相互作用"课题。现主持和参与多项国家"863"、"973"和重大科技攻关课题,至今已在国内外学术刊物发表研究论文30多篇。
电话:021 65643023
传真:021 65643019
Email: kkhuo@fudan.edu.cn
课题组主要成员:
施慧莉,助理实验师
博士研究生:叶晓霞,黎莉,单敬轩,王玮,吴刚,万兵兵,石彦,王均永,石羽杰,周莉,马琪,严晶
硕士研究生:吴小末,傅景庚,伍慧玲,赵晶,钱玮,严忻,张伟,马雅婷,陈虹,吴东华,李濮,
研究方向:
1.功能蛋白质组学研究:侧重于蛋白质功能与蛋白质相互作用网络的研究以及蛋白质连锁图的构建。目前以大规模、高通量人肝蛋白质相互作用研究为主,兼顾其他蛋白质组研究。
2.
功能基因组学研究:侧重于研究人类新基因功能和筛选新药作用靶点的酵母模式生物新技术。目前以肝癌等疾病相关基因功能研究为主,兼顾其他疾病的相关基因研究。
3. 酵母分子生物学研究:侧重于质粒DNA复制,基因表达的转录调控和蛋白质分泌机制。
4. 酵母基因工程高表达系统的应用基础研究:侧重于新的酵母基因表达调控元件、高稳定表达载体和工程菌宿主的构建,以及生物技术重组蛋白药物的高表达研究。
目前主持的科研项目:
1.国家"863"高技术发展计划项目"新型真核系统高效表达体系的构建"课题。
(2002-2005)项目编号(2002AA227011)
2.国家"973"重点基础研究发展规划《人类重大疾病的蛋白质组学研究》项目;蛋白质相互作用及蛋白质功能网络分析的技术体系"课题。
(2002-2007)项目编号(2001CB510203)
3.国家十五科技攻关计划《重大疾病生理病理的蛋白质组》"肝细胞癌变和肝癌转移的蛋白质组研究"课题。
(2003-2005)项目编号(2002BA711A11)
4.国家十五科技攻关计划《中国人类肝脏蛋白质组计划》"人肝蛋白质ORF组和相互作用连锁图的研究"课题。
(2004-2005)项目编号(2004BA711A19)
5.上海市经委高新技术产业科技开发项目"一种新的降血脂药物筛选技术平台"课题。
(2002-2004)
6.上海市科委科研计划项目"利用酵母基因组抗性谱技术筛选新型降血脂中药"课题。
(2002-2004)项目编号(02DZ19146)
承担教学任务:
主讲复旦大学生命学院研究生学位基础课:《基因表达》 54学时。
近年来的主要研究成就和发明专利:
1.国家发明专利《脆壁克鲁维酵母高效转化系统》专利申请日:1997.04.24. 专利申请号:9710643.2;专利公开日:1997.12.03.
专利公开号:CN 1166527A; 专利授权日:2002.10.21. 专利号: ZL 97 1 06403.2;国际专利主分类号:C12N
15/81;专利证书号:60820
发明人:霍克克,唐南筠,袁汉英,王琼庆,李育阳
2.国家发明专利《基于体内同源重组的构建遗传工程生物体的方法》专利申请日:2002.07.30.
专利申请号:0213632.1;专利授权日:2004.08.18. 专利号:ZL 02 1 36302.1;国际专利主分类号:C12N
15/67;专利证书号:167827
发明人:李育阳,陈向岭,何炜,袁汉英,霍克克
3.国家发明专利《肿瘤抑制基因及其编码蛋白和应用》专利申请日:2003.06.20.专利申请号:03129412.X;专利公开日:2005.01.19.
专利公开号:CN 1566148A;专利授权日:2006.2.22; 专利授权公告号:CN 1243017C;专利号:ZL 03 1
29412.X;专利证书号:251629
发明人:霍克克,邸玉君
4.国家二类新药证书《注射用重组人干扰素α2b(酵母)》国药证字S20010042
完成人:李育阳,高卜渝,霍克克 等
5.国家三类新药证书《注射用重组人干扰素α2a(酵母)》国药证字(2000)S-55号
完成人:李育阳,高卜渝,霍克克 等
6. 2001上海市年优秀发明选拔赛一等奖《酵母基因工程人工2a干扰素》证书号:
获奖人:李育阳,高卜渝,霍克克 等
7. 2001上海市年科学技术进步奖二等奖《酵母表达人α干扰素的研究和开发》证书号:012011
获奖人:李育阳,高卜渝,霍克克 等
培养研究生:
|
年度
|
培养人数
|
毕业人数
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||
| 博士生 | 硕士生 | 博士生 | 硕士生 | |
| 1999 | 0 | 2 | 0 | 1 |
| 2000 | 1 | 2 | 0 | 1 |
| 2001 | 1 | 3 | 0 | 1 |
| 2002 | 1 | 1 | 1 | 3 |
| 2003 | 2 | 2 | 1 | 2 |
| 2004 | 3 | 6 | 1 | 1 |
| 2005 | 7 | 2 | 1 | 1 |
发表的主要论文:
打*号的为通讯作者(*:corresponding author):
1.Huo KK, Yu LL, Chen XJ, Li YY. A stable vector for high-level expression
and secretion of human interferon alpha A in yeast. Science in China (Series
B) 1993; 36:557-567.
2.Huo K, Li Y. Cloning and expression of Kluyveromyces fragilis LAC4 gene.
Science in China (Series B). 1995; Nov; 38(11):1332-40.
3. Tang NY, Huo KK, Li YY. The Construction and Application of the
Multi-copy Integration Vector in K. lactis. Sheng Wu Hua Xue Yu Sheng Wu Wu
Li Xue Bao (Shanghai). 1996; 28(5):540-546.
4.Xue Y, Tang NY, Wang QQ, Huo KK, Li YY. Cloning of the K. fragilis PDI
Gene. Sheng Wu Hua Xue Yu Sheng Wu Wu Li Xue Bao (Shanghai). 1997;
29(1):69-75
5.Xu GZ, Pan F, Huo KK, Li YY. Cloning of DNA Fragments Possessing Promoter
Function from Kluyveromyces cicerisporus. Sheng Wu Hua Xue Yu Sheng Wu Wu Li
Xue Bao (Shanghai). 1998; 30(1):35-40.
6.Pan F, Wang QQ, Xu GZ, Tang NY, Huo KK, Li YY. Cloning of GAP Gene from K.
fragilis. Sheng Wu Hua Xue Yu Sheng Wu Wu Li Xue Bao (Shanghai).
1998;30(1):41-46.
7.Zhang PW, Luo ZW, Chen L, Huo KK, Li YY. Analysis of Phylogenetic
Relationships Among Twelve Yeast Species. Sheng Wu Hua Xue Yu Sheng Wu Wu Li
Xue Bao (Shanghai). 1999;31(4):477-478.
8. Huo KK*, Tang NY, Zhang D, Lu SF, and Li YY. Two DNA replication origin
identified in the K1 killer toxin gama subunit gene promoter. Current
Genetics 1999; 35(3-4): 335
9.Bao WG, Huo KK, Li YY, Fukuhara H. Protein disulphide isomerase genes of
Kluyveromyces lactis. Yeast. 2000; Mar 15;16(4):329-41.
10.Zhao X, Huo KK, Li YY. Synonymous codon usage in Pichia pastoris. Sheng
Wu Gong Cheng Xue Bao. 2000 May;16(3):308-11. Chinese.
11. Pan H, Qin WX, Huo KK, Wan DF, Yu Y, Xu ZG, Hu QD, Gu KT, Zhou XM, Jiang
HQ, Zhang PP, Huang Y, Li YY, Gu JR. Cloning, mapping, and characterization
of a human homologue of the yeast longevity assurance gene LAG1. Genomics.
2001 Sep;77(1-2):58-64.
12. Guan XY, Sham JS, Tang TC, Fang Y, Huo KK, Yang JM. Isolation of a novel
candidate oncogene within a frequently amplified region at 3q26 in ovarian
cancer. Cancer Res. 2001 May 1;61(9):3806-9.
13.Pan W, Liao W, Huo K. Construction of Cryptococcus neoformans cap70
transformation system Zhonghua Yi Xue Za Zhi. (2001) Jun 25;81(12):748-51.
Chinese.
14.Tang TC, Sham JS, Xie D, Fang Y, Huo KK, Wu QL, Guan XY. Identification
of a candidate oncogene SEI-1 within a minimal amplified region at 19q13.1
in ovarian cancer cell lines. (2002) Cancer Res. 62(24):7157-7161.
15.He X, Di Y, Li J, Xie Y, Tang Y, Zhang F, Wei L, Zhang Y, Qin W, Huo K,
Li Y, Wan D, Gu J. Moleculari cloning and characterization of CT120, a novel
membrane-associated gene involved in amino acid transport and glutathione
metabolism.(2002) Biochemical and Biophysical Research Communications 297:
528-536
16.Zhang J, Yuan H, Wen T, Xu F, Di Y, Huo K, Li YY. Cloning of the KcURA3
gene and development of a transformation system for Kluyveromyces
cicerisporus. (2003) Appl Microbiol Biotechnol. 2003 Sep;62(4):387-91.
17.Di Y, Li J, Fang J, Xu Z, He X, Zhang F, Ling J, Li X, Xu D, Li L, Li YY,
Huo KK*. Cloning and Characterization of the Novel Gene, which Encodes a
Protein Interacting with the Mitosis-Associated Kinase like Protein NTKL.
Journal of Human Genetics 2003;48(6):315-21. Epub 2003 May 29.
18.Di Y, Li J, Zhang Y, He X, Lu H, Xu D, Ling J, Huo K, Wan D, Li YY, Gu J.
HCC-associated protein HCAP1, a variant of GEMIN4, interacts with
zinc-finger proteins. J Biochem (Tokyo). 2003 Jun;133(6):713-8.
19.Hu QD, Lu H, Huo KK, Ying K, Li J, Xie Y, Mao Y, Li YY. A human homolog
of the yeast gene encoding tRNA 2'-phosphotransferase: cloning,
characterization and complementation analysis. Cell Mol Life Sci. 2003
Aug;60(8):1725-32.
20. Xu ZG, Du JJ, Zhang X, Cheng ZH, Ma ZZ, Xiao HS, Yu L, Wang ZQ, Li YY,
Huo KK*, Han ZG*. A novel liver-specific zona pellucida domain containing
protein that is expressed rarely in hepatocellular carcinoma. Hepatology.
2003 Sep;38(3):735-44.
21. Zhang L, Zhang F, Huo KK*. Cloning and characterization of a novel
splicing variant of the ZADH1 gene. Cytogenet Genome Res.
2003;103(1-2):79-83.
22.Xu ZG, Du JJ, Cui SJ, Wang ZQ, Huo KK, Li YY, Han ZG. Identification of
LZP gene from Mus musculus and Rattus norvegicus coding for a novel
liver-specific ZP domain-containing secretory protein. DNA Seq. 2004
Apr;15(2):81-7.
23. Zhang L, Li J, Wang C, Ma Y, Huo KK*. A new human gene hNTKL-BP1
interacts with hPirh2. Biochem Biophys Res Commun. 2005 Apr 29;330(1):293-7.
24. Ye XX, Lu H, Yu Y, Ding N, Zhang NL, Huo KK, Wan DF, Li YY, Gu JR. P5644
interacts with phosphatidylinositol-4-phosphate adaptor protein-1 associated
protein-1.Mol Cell Biochem. 2005 Mar;271(1-2):151-8.
25.刘 锋, 霍克克, 李育阳 非常规酵母基因工程表达系统.生物工程学报(1996)12 (1): 1-5
26.霍克克*,张 迪,唐南筠,陆身枫,李育阳 一个具有启动子功能的酵母DNA自主复制起始区 高技术通讯 (2000) Vol.10 (113):
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27.苏燕,霍克克*,赵翔,李育阳 脆壁克鲁维酵母KfPDI基因高表达菌株的构建 高技术通讯 (2001) Vol.11 (129): 23-27
28.徐志刚,霍克克*,李育阳 酵母基因中断技术 生物化学与生物物理进展 (2001) Vol.28 (2): 176-180
29. 潘 辉,覃文新,霍克克,万大方,周筱梅,张萍萍,李育阳,顾健人 酵母LAG1 同源的人类长寿保障新基因LASS2的克隆和功能研究,肿瘤
2002,22(2):90-95
30.姚笑迪,霍克克*, 方季 戈万忠 李育阳 人凝血因子IX在脆壁克鲁维酵母中的表达与分泌 高技术通讯,(2003) Vol.13
(150):26-29
31.单敬轩,霍克克*,李育阳 脆壁克鲁维酵母KfADE5,7基因的克隆及其5'非编码区结构与功能研究 高技术通讯 (2003) Vol.13
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32. 张丽萍,霍克克* 蛋白质相互作用研究技术进展,高技术通讯 (2003),13(11):99-106.
33. 张 迪,霍克克* 真核DNA复制起始点的结构与功能研究进展,高技术通讯 (2003), 13(12):98-102.
34.万兵兵,叶晓霞,石彦,黎莉,施慧莉,霍克克* 肝核转录因子FOXA3相互作用蛋白的初步研究,复旦学报 (2005),44(4):477-483
35. 谭永林,徐冬斌,张达力,施慧莉,陈家宽*,霍克克* 酵母降胆固醇药物筛选模型的建立与应用. 复旦学报 (2005),44(4):490-497
36. 石羽杰,王玮,霍克克* 蛋白质芯片技术的新进展. 科技导报(2005),23(9):59-62.
37. 严晶,霍克克* 双分子荧光互补技术及其在蛋白相互作用研究中的应用. 生物化学与生物物理进展 (2006) Vol.33. 已接受。