严军
中科院-马普学会计算生物学伙伴研究所
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研究方向: 功能基因组学

研究方向目前主要包括冬眠过程中基因表达变化的研究和生物序列分析的研究。

1.冬眠作为一种极端的生理过程是长期自然选择的结果。冬眠动物采取了一系列抑制新陈代谢和自我保护等措施在恶劣的环境中存活。我们采取高通量高密度的测定方法对北极地鼠(Arctic ground squirrel)在冬眠过程中基因表达的变化进行了系统研究。该研究发现一系列涉及新陈代谢，抗氧化物合成，输运，解毒，心肌收缩，肌肉退化， 细胞凋亡，生物钟等重要功能的基因的表达在冬眠过程中发生显著的变化。 该研究成果不但在很大程度上推进了对冬眠分子机制的理解，并且有助于设计新的药物治疗人体在类似情况下引发的疾病。 

2.采取计算分析方法通过mRNA, EST, 和基因组序列的比对研究了在人，小鼠， 和大鼠基因组中选择性聚腺苷酸化(alternative polyadenylation)的分布。该研究发现选择性聚腺苷酸化在哺乳动物基因组中广泛存在并可归纳为四类，并且选择性聚腺苷酸化可导致新蛋白质或非编码RNA的产生。研究这些非编码RNA的功能有助于加深我们对转录组的了解。

 　
个人简介 
1994-1998 复旦大学物理系                        学生

1998-2003 美国纽约大学                          博士研究生

2003-     美国阿拉斯加费尔班克斯大学            博士后 
 
主要论文
Selected Publications:

[1] Guang-jiong Ni, Hong Guan, Wei-min Zhou, and Jun Yan, Antiparticle in the light of Einstein-Podolsky-Rosen Paradox and Klein Paradox, Chinese Physics Letters, Vol. 17, No. 6, 2000, 393-395

[2] Jun Yan, Harmonic Interaction Model and Its Applications in Bose-Einstein Condensation, Journal of Statistical Physics, Vol. 113, Nos. 3/4, Nov. 2003, 623-634

[3] K. K. Mon, J. K. Percus, and Jun Yan, Quasi One-Dimensional Self-Diffusion, Molecular Simulation, Vol. 29 (12), Dec. 2003, 721-726

[4] Jun Yan and Thomas G. Marr, Computational analysis of 3’-ends of ESTs shows four classes of alternative polyadenylation in human, mouse, and rat, Genome Research, Vol. 15, 2005, 369-375

[5] Jun Yan, Adlai Burman, Calen Nichols, Linda Alila, Louise C. Showe, Michael K. Showe, Bert B. Boyer, Brian M. Barnes, and Thomas G. Marr, Detection of differential gene expression in brown adipose tissue of hibernating arctic ground squirrels with mouse microarrays. Physiol Genomics 25: 346-353, 2006.